南瓜中富含的果膠，可以延緩腸道對糖和脂質的吸收，還可以清除體內重金屬和部分農藥，故有防癌排毒的作用。南瓜中含有人體所需的多種氨基酸，其中賴氨酸、亮氨酸、異亮氨酸、苯丙氨酸、蘇氨酸等含量較高。此外，南瓜中的抗壞血酸氧化酶基因型與煙草中相同，但活性明顯高于煙草，表明了在南瓜中免疫活性蛋白的含量較高。